北京十二中学生会是在校党总支指导下，在校团委的直接领导下的进行自我教育、自我管理、自我服务的群众性学生组织，是广大同学利益的忠实代表和维护者，是学生和学校各部门间联系的桥梁和纽带，是培养学生成长成才的重要载体。
　　学生会现设文体部、学习部、外联部、宣传部、生活部共计5个部门，实行主席负责制。在各项工作中，各部门间本着“分工不分家”的原则，相互协调、相互合作，全面服务学生学习和生活。
　　学生会每年补选一次，每一届的学生会成员的产生都经过严格的面试、工作实践和竞选演讲、学生代表投票等过程。
　　学生会组织的多项活动深受同学欢迎，例如“情系暖冬，感恩之行”送祝福、校服熊售卖、学生大讲堂、废纸换新本、十二好声音、新年舞会、校园篮球赛、伙食委员会座谈、传统文化节、智闯钟楼答题等活动不仅为广大同学提供了展示自身风采的广阔舞台，为来自不同年级的学生提供了交流的平台，而且在建设锐意进取、和谐斑斓的校园文化进程中发挥了中坚力量。